۱-مبانی مدرسه درباره مسائل تربیتی و سیاسی
در این مدرسه سعی تمام براین است که فعالیتهای تربیتی وبصیرتی، با مبانی مرحوم آیت الله خوشوقت أعلی الله مقامه الشریف در ذیل مبانی کلان ولی امر مسلمین حضرت آیت الله العظمی امام خامنه ای مدظله تطابق حداکثری داشته باشد.
۲-هدف و برنامه مدرسه در بُعد معیشتی طلاب مدرسه
مدرسه برنامه علیرغم داشتن برنامه جامع حمایتی برای طلاب محترم، به گونه ای تدبیر کرده است که این حمایتها منافاتی با عزت طلبه و فضائل اخلاقی و روحیه توکل و اعتقاد به رزاقیت خداوند و واسطه بودن خلق و رزق من حیث لا یحتسب، نداشته باشد
۳-کیفیت و نحوه برگزاری درس اخلاق
بعد از رحلت حضرت آیت الله خوشوقت أعلی الله مقامه الشریف برنامه مدرسه درخصوص درس اخلاق، غالبا متمرکز بر استفاده از بیانات مضبوط آن مرحوم (فیلم های ضبط شده از درس های اخلاق و جلسات پرسش و پاسخ) بوده است که به صورت هفتگی در مراسم ختم صلوات پخش می گردد؛ علاوه بر این سرمایه معنوی، در این جلسات از محضر مستفیدان آن مرحوم و أعزه و علمایی که از لحاظ فکری و رفتاری قرابت بیشتری به مبانی آن مرحوم دارند استفاده حداکثری می گردد.
۴-برنامه مدرسه در مناسبت‌های مذهبی و فرهنگی
جلسات فرهنگی مدرسه شامل موارد ذیل می باشد:
- جلسات ختم صلوات: طبق سنت هر ساله، سه شنبه ها جلسات ختم صلوات و اطعام مومنین با حضور قابل توجه طلاب و اساتید حاضر و خارج از مدرسه برگزار می شود. در این برنامه معنوی علاوه بر ختم ذکر شریف صلوات، توسل به اهل بیت(علیهم السلام) و پخش بیانات ارزشمند مرحوم آیت الله خوشوقت (اعلی الله مقامه الشریف) و استفاده از افاضات سخنرانان، نیز انجام می پذیرد؛ در خصوص اهمیت و ضرورت جلسات ختم صلوات، فایل مجزایی ان شاءالله در سایت قرار داده می شود که این عمل حسنه تبدیل به یک سنت حسنه و رایج در جامعه مومنین شود.
- جلسات مناسبتی و مذهبی: در اعیاد و وفیات متناسب با مناسبت مربوطه مجلسی در همان روز علاوه بر برگزاری دروس، منعقد می گردد.
- جلسات خانوادگی مناسبتی: در برخی مناسبت ها علاوه بر برگزاری مجلس اهل بیت(علیهم السلام) در روز مناسبت، جلسات خانوادگی ختم صلوات و توسل نیز برگزار می گردد.
- بنا بر تاکید موسس محترم مدرسه بر انجام سنت حسنه اعتکاف در هر فرصت مناسب سال، اعتکاف طلاب هر فصل یک بار، در مسجد مقدس جمکران برگزار می گردد.
- با عنایت به حضور مشاور به صورت سه روز در هفته، طلاب محترم با تعیین نوبت قبلی می توانند به گروه مشاوران مدرسه مراجعه نموده و بهره کافی و وافی را داشته باشند؛ علاوه بر مراجعات شخصی، استعداد سنجی طلاب نیز توسط مشاوران محترم، برای تعیین سمت و سوی آینده علمی و فعالیتی خود صورت می پذیرد.
۵-جلسات آموزشی و مهارتی برای خانواده های طلاب
با توجه به اهمیت تدبیر منزل و تربیت فرزند، سلسله جلسات آموزشی روش تعامل با همسر و روش تربیت فرزند توسط مشاور و روانشناس خانم برگزار می گردد.
۶-نشست های سیاسی مدرسه
در بازه های مختلف زمانی نشست سیاسی با حضور کارشناس سیاسی جهت ارائه اخبار و تحلیل های روز و پاسخ به سؤالات طلاب محترم برقرار می باشد.
۷-کلاس های آموزش مهارت های زندگی و انتخاب همسر
سلسله مباحثی برای طلاب مجرد برای تعیین ملاکات انتخاب همسر و نکات مربوط به انتخاب همسر به صورت دوره ای برگزار می گردد
۸-اردو های تبلیغی و جهادی
با عنایت به تاکید مقام معظم رهبری مبنی بر فعالیت اجتماعی روحانیون اردوهای جهادی در فرصت های مناسب که عموما در مناسبت ها اتفاق می افتد به عنوان یکی از روشهای تبلیغی و تبلیغ با رویکرد اجتماعی برگزار می گردد
در این اردوها علاوه بر فعالیت عمرانی توسط طلاب و آموزش های عملی در این زمینه به طلاب، فعالیت تبلیغی نیز انجام می شود که علاوه بر حضور مبلغین با تجربه، طلابی که اولین تجربه تبلیغی خود را سپری می کنند دارای مهارت عملی در تبلیغ می شوند. همچنین ضمن تمرین فعالیت فرهنگی به صورت تشکیلاتی طلاب، مسؤولیت بخش های مختلف تشکیلات به عهده طلاب قرار گرفته، تمرین مدیریت فرهنگی نیز عملا صورت می گیرد.
علاوه بر آن در بازه های زمانی مختلف تبلیغی مانند ماه مبارک رمضان، دهه فاطمیه، دهه اول محرم، و بخشی از تابستان تبلیغ گروهی به صورت حضور خانوادگی یا مجردی با رویکرد تبلیغ دانش آموزی در نقاط مختلفی که زمینه آن فراهم شده باشد صورت می پذیرد.
۹-آموزشهای تبلیغی به طلاب
دوره آموزش تبلیغ دانش آموزی یا انواع دیگری از تبلیغ که زمینه آن مهیا می شود برای طلاب مستعد و علاقه مند توسط استاد با تجربه صورت می پذیرد
۱۰-شبکه شناسایی و کمک به محرومین
در راستای فرمایشات مقام معظم رهبری (حفظه الله و ادام الله ظله الشریف) و دغدغه های معظم له در رابطه با شهر مقدّس قم، گروهی از طلاب مدرسه در راستای فعالیت اجتماعی و انجام وظیفه در زمینه امور اجتماعی، توفیق شناسایی محرومین و واسطه رساندن کمک و مساعدت خیرین به آنان با اهداف فرهنگی و انقلابی، داشته اند.